民国时期

民国三年（一九一二年），炳瑞法师由金仙寺迁五磊寺任住持，遂重建大雄宝殿，翌年建成。

自民国四年（一九一五年）至民国十年（一九二二年）先后拆造、重建殿堂，修葺已倾圮殿宇，共计大小八十馀间，并同时收回典地，翻恳竹山，植树造林，整敕寺规，佛事自受清末民初战火影响后，随之复兴，楮?再护重光。

民国十六年（一九二七年），谛闲法师复监五磊寺主持讲席，并设坛传戒僧徒，慈溪、象山、镇海、余姚、奉化等地僧徒百馀名到寺剃度受戒。

民国二十年（一九三一年）春，金仙寺住持亦幻法师，倡办律学道场，并邀弘一法师至五磊寺主持“南山律学院”，弘一法师乃于是年农历五月至五磊寺，七月十三日授菩萨戒，发弘律誓愿，开办律学道场。

民国二十一年（一九三二年）七月二日，谛闲法师在宁波观宗寺圆寂。其法徒炳瑞、宝顺等将灵龛迎至五磊山，并于寺东牛角峰下建塔。

民国三十年（一九四一）四月，日本侵略军占领慈溪。五磊寺成为了我党抗日武装重要驻地，并成为浙东区党委和三北游击司令部重要会议场所。